| 1 | FC Flora | 62,1% (18) 27,6% (8) 3,4% (1) 6,9% (2) | 29 | 21,4 |
| 2 | Salzburg | 57,5% (23) 35,0% (14) 5,0% (2) 2,5% (1) | 40 | 22,0 |
| 3 | Minsk | 37,9% (11) 48,3% (14) 6,9% (2) 3,4% (1) | 29 | 23,0 |
| 4 | HJK Helsinki | 42,0% (21) 42,0% (21) 4,0% (2) 6,0% (3) | 50 | 23,0 |
| 5 | Larne FC | 33,3% (10) 40,0% (12) 16,7% (5) 3,3% (1) | 30 | 24,3 |
| 6 | Gl. Rangers | 19,4% (6) 54,8% (17) 16,1% (5) | 31 | 24,3 |
| 7 | Dinamo Batumi | 30,0% (9) 50,0% (15) 16,7% (5) | 30 | 24,4 |
| 8 | P. Belgrad | 36,0% (18) 42,0% (21) 18,0% (9) 4,0% (2) | 50 | 24,5 |
| 9 | FC Twente | 22,6% (7) 64,5% (20) 3,2% (1) 9,7% (3) | 31 | 24,7 |
| 10 | R. S. Belgrad | 32,6% (15) 34,8% (16) 26,1% (12) 6,5% (3) | 46 | 24,8 |
| 11 | Bodö/Glimt | 25,8% (8) 54,8% (17) 19,4% (6) | 31 | 24,8 |
| 12 | Bialystok | 24,3% (9) 56,8% (21) 16,2% (6) 2,7% (1) | 37 | 24,9 |
| 13 | M. Tel Aviv | 28,9% (11) 44,7% (17) 10,5% (4) 10,5% (4) | 38 | 24,9 |
| 14 | Sparta Prag | 19,5% (8) 61,0% (25) 17,1% (7) 2,4% (1) | 41 | 25,0 |
| 15 | St. Gilloise | 30,6% (11) 55,6% (20) 8,3% (3) 5,6% (2) | 36 | 25,0 |
| 16 | Lugano | 18,9% (7) 64,9% (24) 10,8% (4) 5,4% (2) | 37 | 25,0 |
| 17 | Y.B. Bern | 20,9% (9) 62,8% (27) 11,6% (5) 4,7% (2) | 43 | 25,0 |
| 18 | Malmö FF | 33,3% (12) 38,9% (14) 13,9% (5) 13,9% (5) | 36 | 25,1 |
| 19 | Slavia Prag | 17,5% (7) 57,5% (23) 20,0% (8) 2,5% (1) | 40 | 25,1 |
| 20 | KF Ballkani | 15,2% (5) 57,6% (19) 15,2% (5) 3,0% (1) | 33 | 25,1 |
| 21 | Dynamo Kiev | 15,4% (6) 59,0% (23) 17,9% (7) 2,6% (1) | 39 | 25,3 |
| 22 | D. Zagreb | 29,3% (12) 41,5% (17) 17,1% (7) 9,8% (4) | 41 | 25,4 |
| 23 | Midtjylland | 28,1% (9) 40,6% (13) 25,0% (8) 3,1% (1) | 32 | 25,5 |
| 24 | Celje | 16,7% (6) 55,6% (20) 25,0% (9) 2,8% (1) | 36 | 25,6 |
| 25 | Lille | 28,6% (10) 40,0% (14) 17,1% (6) 14,3% (5) | 35 | 25,6 |
| 26 | Egnatia | 10,7% (3) 67,9% (19) 17,9% (5) 3,6% (1) | 28 | 25,6 |
| 27 | Galatasaray | 22,0% (9) 43,9% (18) 29,3% (12) 4,9% (2) | 41 | 26,2 |
| 28 | Banja Luka | 20,5% (8) 41,0% (16) 30,8% (12) 7,7% (3) | 39 | 26,3 |
| 29 | Hamrun Spart | 32,3% (10) 29,0% (9) 12,9% (4) 16,1% (5) | 31 | 26,3 |
| 30 | Apoel FC | 24,4% (10) 31,7% (13) 17,1% (7) 17,1% (7) | 41 | 26,4 |
| 31 | Ekranas | 21,4% (6) 35,7% (10) 32,1% (9) 10,7% (3) | 28 | 26,4 |
| 32 | Sta Coloma | 6,2% (2) 50,0% (16) 18,8% (6) 3,1% (1) | 32 | 26,6 |
| 33 | Steaua | 14,7% (5) 47,1% (16) 26,5% (9) 8,8% (3) | 34 | 26,6 |
| 34 | Llansantffraid | 15,6% (5) 34,4% (11) 18,8% (6) 9,4% (3) | 32 | 26,6 |
| 35 | Differdingen | 16,0% (4) 52,0% (13) 20,0% (5) 8,0% (2) | 25 | 26,7 |
| 36 | Fenerbahce | 23,4% (11) 36,2% (17) 29,8% (14) 10,6% (5) | 47 | 26,7 |
| 37 | FC Petrocub | 14,3% (4) 50,0% (14) 17,9% (5) 17,9% (5) | 28 | 26,8 |
| 38 | Shamrock | 14,3% (5) 28,6% (10) 34,3% (12) 2,9% (1) | 35 | 26,9 |
| 39 | Klaksvik | 12,5% (3) 50,0% (12) 25,0% (6) 12,5% (3) | 24 | 26,9 |
| 40 | Riga FC | 20,0% (6) 33,3% (10) 26,7% (8) 13,3% (4) | 30 | 27,0 |
| 41 | Ferencvárosi | 9,3% (4) 48,8% (21) 37,2% (16) 4,7% (2) | 43 | 27,2 |
| 42 | FC Struga Trim | 16,7% (4) 33,3% (8) 20,8% (5) 16,7% (4) | 24 | 27,2 |
| 43 | Vik. Reykjav | 18,2% (6) 30,3% (10) 15,2% (5) 21,2% (7) | 33 | 27,2 |
| 44 | Karabakh | 3,3% (1) 56,7% (17) 36,7% (11) | 30 | 27,3 |
| 45 | Ludogorets | 9,4% (3) 53,1% (17) 31,2% (10) 6,2% (2) | 32 | 27,3 |
| 46 | SK SLovan | 13,3% (4) 46,7% (14) 23,3% (7) 16,7% (5) | 30 | 27,5 |
| 47 | FK Decic Tuzi | 4,0% (1) 40,0% (10) 12,0% (3) 16,0% (4) | 25 | 28,2 |
| 48 | Lincoln FC | 14,3% (5) 25,7% (9) 31,4% (11) 14,3% (5) | 35 | 28,2 |
| 49 | Ordabassy | 47,1% (8) 35,3% (6) 11,8% (2) | 17 | 28,6 |
| 50 | PAOK Saloniki | 10,8% (4) 35,1% (13) 43,2% (16) 10,8% (4) | 37 | 28,6 |
| 51 | Pjunik | 6,9% (2) 20,7% (6) 62,1% (18) 10,3% (3) | 29 | 29,4 |
| 52 | SS Virtus | 41,9% (13) 19,4% (6) 35,5% (11) | 31 | 30,9 |
Champions League-Qualifikation
