| 1 | Salzburg | 55,0% (11) 40,0% (8) 5,0% (1) | 20 | 22,0 |
| 2 | FC Flora | 53,3% (8) 26,7% (4) 20,0% (3) | 15 | 24,1 |
| 3 | Y.B. Bern | 23,8% (5) 71,4% (15) 4,8% (1) | 21 | 24,4 |
| 4 | St. Gilloise | 22,2% (4) 72,2% (13) 5,6% (1) | 18 | 24,9 |
| 5 | Midtjylland | 25,0% (6) 50,0% (12) 16,7% (4) 4,2% (1) | 24 | 25,0 |
| 6 | Lugano | 11,8% (2) 70,6% (12) 17,6% (3) | 17 | 25,2 |
| 7 | FC Twente | 19,0% (4) 61,9% (13) 4,8% (1) 14,3% (3) | 21 | 25,3 |
| 8 | Sta Coloma | 5,3% (1) 57,9% (11) 10,5% (2) | 19 | 25,5 |
| 9 | Dynamo Kiev | 16,7% (4) 58,3% (14) 20,8% (5) 4,2% (1) | 24 | 25,5 |
| 10 | Lille | 20,0% (4) 50,0% (10) 10,0% (2) 15,0% (3) | 20 | 25,7 |
| 11 | Slavia Prag | 25,0% (5) 45,0% (9) 25,0% (5) 5,0% (1) | 20 | 25,8 |
| 12 | Minsk | 11,1% (2) 66,7% (12) 5,6% (1) 16,7% (3) | 18 | 25,8 |
| 13 | Egnatia | 81,2% (13) 12,5% (2) 6,2% (1) | 16 | 25,9 |
| 14 | HJK Helsinki | 23,5% (4) 58,8% (10) 17,6% (3) | 17 | 26,1 |
| 15 | Bodö/Glimt | 9,5% (2) 71,4% (15) 19,0% (4) | 21 | 26,1 |
| 16 | Sparta Prag | 80,0% (20) 20,0% (5) | 25 | 26,3 |
| 17 | Larne FC | 20,0% (3) 46,7% (7) 20,0% (3) 6,7% (1) | 15 | 26,6 |
| 18 | Bialystok | 10,5% (2) 57,9% (11) 26,3% (5) 5,3% (1) | 19 | 26,7 |
| 19 | Dinamo Batumi | 71,4% (10) 28,6% (4) | 14 | 26,8 |
| 20 | Gl. Rangers | 15,8% (3) 47,4% (9) 31,6% (6) 5,3% (1) | 19 | 26,8 |
| 21 | D. Zagreb | 11,8% (2) 52,9% (9) 29,4% (5) 5,9% (1) | 17 | 26,9 |
| 22 | KF Ballkani | 5,3% (1) 57,9% (11) 15,8% (3) 10,5% (2) | 19 | 26,9 |
| 23 | Banja Luka | 15,0% (3) 50,0% (10) 25,0% (5) 10,0% (2) | 20 | 27,0 |
| 24 | Ferencvárosi | 8,3% (2) 58,3% (14) 29,2% (7) 4,2% (1) | 24 | 27,0 |
| 25 | Steaua | 4,5% (1) 68,2% (15) 18,2% (4) 9,1% (2) | 22 | 27,0 |
| 26 | Celje | 9,5% (2) 52,4% (11) 33,3% (7) 4,8% (1) | 21 | 27,0 |
| 27 | R. S. Belgrad | 6,2% (1) 62,5% (10) 31,2% (5) | 16 | 27,2 |
| 28 | Malmö FF | 26,1% (6) 30,4% (7) 21,7% (5) 21,7% (5) | 23 | 27,2 |
| 29 | Riga FC | 10,5% (2) 42,1% (8) 36,8% (7) 5,3% (1) | 19 | 27,3 |
| 30 | M. Tel Aviv | 13,3% (2) 40,0% (6) 40,0% (6) 6,7% (1) | 15 | 27,5 |
| 31 | FK Decic Tuzi | 5,6% (1) 50,0% (9) 16,7% (3) 11,1% (2) | 18 | 27,5 |
| 32 | P. Belgrad | 11,1% (2) 44,4% (8) 38,9% (7) 5,6% (1) | 18 | 27,6 |
| 33 | Hamrun Spart | 16,7% (3) 33,3% (6) 22,2% (4) 16,7% (3) | 18 | 27,7 |
| 34 | SK SLovan | 9,1% (2) 45,5% (10) 31,8% (7) 13,6% (3) | 22 | 27,8 |
| 35 | FC Petrocub | 7,1% (1) 42,9% (6) 35,7% (5) 14,3% (2) | 14 | 27,9 |
| 36 | Differdingen | 64,7% (11) 29,4% (5) 5,9% (1) | 17 | 27,9 |
| 37 | Llansantffraid | 58,8% (10) 29,4% (5) | 17 | 28,0 |
| 38 | Karabakh | 4,5% (1) 45,5% (10) 45,5% (10) 4,5% (1) | 22 | 28,2 |
| 39 | Vik. Reykjav | 12,5% (2) 37,5% (6) 25,0% (4) 25,0% (4) | 16 | 28,2 |
| 40 | Fenerbahce | 4,8% (1) 52,4% (11) 33,3% (7) 9,5% (2) | 21 | 28,3 |
| 41 | Ludogorets | 57,1% (12) 33,3% (7) 9,5% (2) | 21 | 28,3 |
| 42 | Shamrock | 53,3% (8) 40,0% (6) 6,7% (1) | 15 | 28,7 |
| 43 | FC Struga Trim | 41,2% (7) 23,5% (4) 23,5% (4) | 17 | 29,0 |
| 44 | Galatasaray | 5,6% (1) 38,9% (7) 44,4% (8) 11,1% (2) | 18 | 29,1 |
| 45 | PAOK Saloniki | 10,0% (2) 30,0% (6) 45,0% (9) 15,0% (3) | 20 | 29,4 |
| 46 | Klaksvik | 42,1% (8) 42,1% (8) 15,8% (3) | 19 | 29,6 |
| 47 | Ekranas | 5,3% (1) 26,3% (5) 42,1% (8) 26,3% (5) | 19 | 29,6 |
| 48 | Pjunik | 21,1% (4) 68,4% (13) 10,5% (2) | 19 | 29,7 |
| 49 | Ordabassy | 40,0% (4) 40,0% (4) 20,0% (2) | 10 | 30,0 |
| 50 | Apoel FC | 27,8% (5) 27,8% (5) 38,9% (7) | 18 | 30,9 |
| 51 | Lincoln FC | 26,3% (5) 47,4% (9) 21,1% (4) | 19 | 30,9 |
| 52 | SS Virtus | 38,9% (7) 22,2% (4) 38,9% (7) | 18 | 31,1 |
Champions League-Qualifikation
