| 1 | FC Flora | 54,1% (20) 37,8% (14) 8,1% (3) | 37 | 22,0 |
| 2 | Valmiera FK | 29,6% (8) 66,7% (18) 3,7% (1) | 27 | 22,6 |
| 3 | Sturm Graz | 42,4% (14) 51,5% (17) 6,1% (2) | 33 | 22,8 |
| 4 | Genk | 42,9% (15) 45,7% (16) 8,6% (3) 2,9% (1) | 35 | 23,1 |
| 5 | SSC Farul | 44,2% (19) 34,9% (15) 18,6% (8) 2,3% (1) | 43 | 23,4 |
| 6 | Bananz | 21,1% (4) 68,4% (13) 10,5% (2) | 19 | 23,7 |
| 7 | D. Tiflis | 23,3% (7) 40,0% (12) 10,0% (3) | 30 | 23,7 |
| 8 | P. Tirana | 33,3% (10) 56,7% (17) 6,7% (2) 3,3% (1) | 30 | 23,8 |
| 9 | BATE | 30,0% (9) 40,0% (12) 10,0% (3) 3,3% (1) | 30 | 24,0 |
| 10 | KS Rakow Czest | 31,4% (16) 52,9% (27) 15,7% (8) | 51 | 24,0 |
| 11 | Y.B. Bern | 30,6% (11) 61,1% (22) 5,6% (2) 2,8% (1) | 36 | 24,1 |
| 12 | D. Zagreb | 35,2% (19) 44,4% (24) 13,0% (7) 3,7% (2) | 54 | 24,3 |
| 13 | Molde | 39,0% (16) 34,1% (14) 24,4% (10) 2,4% (1) | 41 | 24,4 |
| 14 | Zalgiris | 32,0% (8) 52,0% (13) 8,0% (2) 8,0% (2) | 25 | 24,5 |
| 15 | FK Tsc Backa T | 38,9% (14) 36,1% (13) 19,4% (7) 5,6% (2) | 36 | 24,5 |
| 16 | Antwerpen | 40,0% (12) 30,0% (9) 13,3% (4) 13,3% (4) | 30 | 24,8 |
| 17 | O. Ljubljana | 21,9% (7) 62,5% (20) 6,2% (2) 6,2% (2) | 32 | 24,8 |
| 18 | Larne FC | 30,3% (10) 45,5% (15) 15,2% (5) 6,1% (2) | 33 | 24,8 |
| 19 | Sparta Prag | 17,9% (7) 71,8% (28) 7,7% (3) 2,6% (1) | 39 | 24,8 |
| 20 | Braga | 33,3% (12) 44,4% (16) 19,4% (7) 2,8% (1) | 36 | 24,8 |
| 21 | Ol. Marseille | 22,2% (10) 57,8% (26) 17,8% (8) 2,2% (1) | 45 | 24,8 |
| 22 | FK Buducnost | 32,4% (11) 29,4% (10) 11,8% (4) 14,7% (5) | 34 | 25,0 |
| 23 | KF Ballkani | 18,5% (5) 59,3% (16) 14,8% (4) 3,7% (1) | 27 | 25,0 |
| 24 | Kopenhagen | 35,9% (14) 30,8% (12) 33,3% (13) | 39 | 25,1 |
| 25 | HJK Helsinki | 37,8% (17) 40,0% (18) 8,9% (4) 13,3% (6) | 45 | 25,2 |
| 26 | S. Tiraspol | 10,9% (5) 65,2% (30) 2,2% (1) 4,3% (2) | 46 | 25,3 |
| 27 | SC Dnipro-1 | 29,0% (9) 35,5% (11) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,3 |
| 28 | Genf | 33,3% (12) 36,1% (13) 22,2% (8) 5,6% (2) | 36 | 25,3 |
| 29 | Shamrock | 23,3% (10) 27,9% (12) 18,6% (8) 4,7% (2) | 43 | 25,4 |
| 30 | Aris Limasso | 31,0% (9) 41,4% (12) 20,7% (6) 3,4% (1) | 29 | 25,5 |
| 31 | Eindhoven | 31,2% (10) 46,9% (15) 12,5% (4) 9,4% (3) | 32 | 25,6 |
| 32 | Kopavogur | 25,0% (6) 37,5% (9) 29,2% (7) 4,2% (1) | 24 | 25,7 |
| 33 | Galatasaray | 28,9% (13) 42,2% (19) 22,2% (10) 4,4% (2) | 45 | 25,9 |
| 34 | BK Häcken | 40,5% (15) 16,2% (6) 27,0% (10) 16,2% (6) | 37 | 26,1 |
| 35 | M. Haifa | 13,5% (7) 44,2% (23) 19,2% (10) 7,7% (4) | 52 | 26,2 |
| 36 | Ferencvárosi | 14,3% (6) 54,8% (23) 28,6% (12) 2,4% (1) | 42 | 26,4 |
| 37 | Mostar | 17,5% (7) 50,0% (20) 27,5% (11) 5,0% (2) | 40 | 26,4 |
| 38 | Gl. Rangers | 19,4% (7) 52,8% (19) 16,7% (6) 8,3% (3) | 36 | 26,5 |
| 39 | FC Struga Trim | 20,8% (5) 37,5% (9) 33,3% (8) 4,2% (1) | 24 | 26,8 |
| 40 | Llansantffraid | 9,7% (3) 32,3% (10) 25,8% (8) | 31 | 26,9 |
| 41 | Karabakh | 3,6% (1) 60,7% (17) 28,6% (8) 3,6% (1) | 28 | 27,0 |
| 42 | Hamrun Spart | 25,7% (9) 28,6% (10) 17,1% (6) 17,1% (6) | 35 | 27,1 |
| 43 | Klaksvik | 23,3% (7) 36,7% (11) 26,7% (8) 13,3% (4) | 30 | 27,1 |
| 44 | Panathinaikos | 15,9% (7) 36,4% (16) 38,6% (17) 9,1% (4) | 44 | 27,1 |
| 45 | SK SLovan | 12,9% (4) 45,2% (14) 29,0% (9) 9,7% (3) | 31 | 27,1 |
| 46 | Ludogorets | 2,9% (1) 57,1% (20) 34,3% (12) 5,7% (2) | 35 | 27,5 |
| 47 | AEK Athen | 9,5% (4) 45,2% (19) 38,1% (16) 7,1% (3) | 42 | 27,6 |
| 48 | Astana | 6,5% (2) 48,4% (15) 32,3% (10) 12,9% (4) | 31 | 27,9 |
| 49 | AC d`Escaldes | 7,1% (2) 28,6% (8) 32,1% (9) 10,7% (3) | 28 | 28,1 |
| 50 | Swift Hesper | 5,7% (2) 42,9% (15) 40,0% (14) 11,4% (4) | 35 | 28,2 |
| 51 | Lincoln FC | 6,7% (2) 33,3% (10) 36,7% (11) 20,0% (6) | 30 | 29,9 |
| 52 | Tre Penne | 7,1% (2) 32,1% (9) 32,1% (9) 28,6% (8) | 28 | 30,8 |
Champions League-Qualifikation
