| 1 | Salzburg | 55,3% (26) 36,2% (17) 8,5% (4) | 47 | 22,5 |
| 2 | Bodö/Glimt | 36,6% (15) 51,2% (21) 12,2% (5) | 41 | 23,2 |
| 3 | Rapid Wien | 47,6% (20) 33,3% (14) 16,7% (7) | 42 | 23,2 |
| 4 | NK Mura | 38,7% (12) 45,2% (14) 12,9% (4) 3,2% (1) | 31 | 23,5 |
| 5 | Kairat | 50,0% (16) 28,1% (9) 18,8% (6) 3,1% (1) | 32 | 23,5 |
| 6 | FC Flora | 42,9% (15) 40,0% (14) 11,4% (4) 5,7% (2) | 35 | 23,5 |
| 7 | Midtjylland | 35,2% (19) 53,7% (29) 7,4% (4) 3,7% (2) | 54 | 23,6 |
| 8 | Shakhtar | 28,8% (17) 59,3% (35) 10,2% (6) 1,7% (1) | 59 | 23,6 |
| 9 | Genk | 39,5% (17) 46,5% (20) 11,6% (5) 2,3% (1) | 43 | 23,8 |
| 10 | D. Zagreb | 35,4% (23) 46,2% (30) 15,4% (10) 3,1% (2) | 65 | 23,9 |
| 11 | Bröndby IF | 36,1% (13) 50,0% (18) 11,1% (4) 2,8% (1) | 36 | 24,0 |
| 12 | Eindhoven | 44,4% (20) 42,2% (19) 8,9% (4) 4,4% (2) | 45 | 24,0 |
| 13 | C. Glasgow | 31,5% (17) 50,0% (27) 16,7% (9) 1,9% (1) | 54 | 24,1 |
| 14 | FC Prishtina | 29,7% (11) 54,1% (20) 8,1% (3) 5,4% (2) | 37 | 24,1 |
| 15 | Y.B. Bern | 31,7% (13) 56,1% (23) 7,3% (3) 4,9% (2) | 41 | 24,1 |
| 16 | Spartak Moskau | 35,4% (17) 54,2% (26) 6,2% (3) 4,2% (2) | 48 | 24,2 |
| 17 | FK Buducnost | 37,9% (11) 34,5% (10) 13,8% (4) 6,9% (2) | 29 | 24,2 |
| 18 | Malmö FF | 37,0% (20) 38,9% (21) 11,1% (6) 11,1% (6) | 54 | 24,4 |
| 19 | Sparta Prag | 22,4% (11) 55,1% (27) 18,4% (9) 2,0% (1) | 49 | 24,6 |
| 20 | Banja Luka | 34,5% (10) 44,8% (13) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,7 |
| 21 | Monaco | 34,0% (16) 42,6% (20) 14,9% (7) 8,5% (4) | 47 | 24,7 |
| 22 | Slavia Prag | 30,4% (17) 44,6% (25) 19,6% (11) 5,4% (3) | 56 | 24,8 |
| 23 | S. Tiraspol | 20,9% (9) 67,4% (29) 7,0% (3) 4,7% (2) | 43 | 24,9 |
| 24 | HJK Helsinki | 31,8% (14) 38,6% (17) 20,5% (9) 9,1% (4) | 44 | 24,9 |
| 25 | HB Torshavn | 23,5% (8) 55,9% (19) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 24,9 |
| 26 | M. Haifa | 25,9% (15) 53,4% (31) 15,5% (9) 5,2% (3) | 58 | 25,0 |
| 27 | R. S. Belgrad | 34,0% (18) 32,1% (17) 28,3% (15) 3,8% (2) | 53 | 25,2 |
| 28 | L. Warschau | 34,0% (16) 38,3% (18) 21,3% (10) 6,4% (3) | 47 | 25,2 |
| 29 | D. Tiflis | 21,6% (8) 43,2% (16) 18,9% (7) 2,7% (1) | 37 | 25,3 |
| 30 | Saligorsk | 19,4% (6) 51,6% (16) 19,4% (6) 6,5% (2) | 31 | 25,5 |
| 31 | N. Baku | 27,6% (8) 41,4% (12) 24,1% (7) 6,9% (2) | 29 | 25,6 |
| 32 | Fola Esch | 27,5% (11) 40,0% (16) 20,0% (8) 12,5% (5) | 40 | 25,6 |
| 33 | Tetovo | 21,2% (7) 57,6% (19) 12,1% (4) 9,1% (3) | 33 | 25,8 |
| 34 | Gl. Rangers | 25,5% (12) 42,6% (20) 17,0% (8) 12,8% (6) | 47 | 26,1 |
| 35 | Galatasaray | 24,3% (17) 47,1% (33) 17,1% (12) 11,4% (8) | 70 | 26,2 |
| 36 | Olympiakos | 19,1% (13) 48,5% (33) 25,0% (17) 7,4% (5) | 68 | 26,2 |
| 37 | Ludogorets | 16,3% (7) 48,8% (21) 25,6% (11) 4,7% (2) | 43 | 26,2 |
| 38 | SK SLovan | 13,6% (6) 54,5% (24) 22,7% (10) 9,1% (4) | 44 | 26,3 |
| 39 | FK Rigas Futbo | 6,7% (3) 62,2% (28) 26,7% (12) 2,2% (1) | 45 | 26,3 |
| 40 | Ferencvárosi | 17,1% (7) 56,1% (23) 24,4% (10) 2,4% (1) | 41 | 26,3 |
| 41 | Shamrock | 27,6% (8) 37,9% (11) 20,7% (6) 13,8% (4) | 29 | 26,3 |
| 42 | Durres | 38,5% (10) 30,8% (8) 7,7% (2) 19,2% (5) | 26 | 26,4 |
| 43 | Benfica | 20,8% (11) 49,1% (26) 22,6% (12) 7,5% (4) | 53 | 26,6 |
| 44 | Zalgiris | 18,5% (5) 48,1% (13) 22,2% (6) 11,1% (3) | 27 | 26,7 |
| 45 | Valur | 19,4% (6) 32,3% (10) 38,7% (12) 6,5% (2) | 31 | 26,8 |
| 46 | Om. Nikosia | 25,6% (11) 27,9% (12) 27,9% (12) 18,6% (8) | 43 | 27,0 |
| 47 | Linfield | 16,7% (6) 41,7% (15) 22,2% (8) 13,9% (5) | 36 | 27,2 |
| 48 | Cluj | 14,8% (8) 48,1% (26) 24,1% (13) 13,0% (7) | 54 | 27,6 |
| 49 | Paola | 18,2% (8) 36,4% (16) 25,0% (11) 20,5% (9) | 44 | 27,7 |
| 50 | Connah's Quay | 3,7% (1) 37,0% (10) 29,6% (8) 14,8% (4) | 27 | 28,1 |
| 51 | Martuni | 5,3% (2) 36,8% (14) 44,7% (17) 13,2% (5) | 38 | 28,8 |
| 52 | Lincoln FC | 9,8% (4) 41,5% (17) 24,4% (10) 24,4% (10) | 41 | 29,1 |
| 53 | Folgore | 2,2% (1) 26,7% (12) 48,9% (22) 22,2% (10) | 45 | 30,4 |
| 54 | Inter Club de | 1,7% (1) 25,4% (15) 16,9% (10) 47,5% (28) | 59 | 32,5 |
Champions League-Qualifikation
