| 1 | Salzburg | 55,6% (25) 35,6% (16) 8,9% (4) | 45 | 22,6 |
| 2 | Kairat | 53,3% (16) 30,0% (9) 13,3% (4) 3,3% (1) | 30 | 23,2 |
| 3 | Bodö/Glimt | 35,9% (14) 51,3% (20) 12,8% (5) | 39 | 23,3 |
| 4 | Rapid Wien | 46,5% (20) 34,9% (15) 16,3% (7) | 43 | 23,3 |
| 5 | FC Flora | 45,9% (17) 37,8% (14) 10,8% (4) 5,4% (2) | 37 | 23,4 |
| 6 | NK Mura | 38,7% (12) 45,2% (14) 12,9% (4) 3,2% (1) | 31 | 23,5 |
| 7 | Midtjylland | 35,3% (18) 54,9% (28) 5,9% (3) 3,9% (2) | 51 | 23,5 |
| 8 | Shakhtar | 28,1% (16) 59,6% (34) 10,5% (6) 1,8% (1) | 57 | 23,7 |
| 9 | Genk | 39,5% (17) 46,5% (20) 11,6% (5) 2,3% (1) | 43 | 23,8 |
| 10 | D. Zagreb | 36,5% (23) 44,4% (28) 15,9% (10) 3,2% (2) | 63 | 23,9 |
| 11 | Eindhoven | 45,5% (20) 40,9% (18) 9,1% (4) 4,5% (2) | 44 | 23,9 |
| 12 | Bröndby IF | 40,0% (14) 45,7% (16) 11,4% (4) 2,9% (1) | 35 | 23,9 |
| 13 | C. Glasgow | 31,5% (17) 50,0% (27) 16,7% (9) 1,9% (1) | 54 | 24,1 |
| 14 | FC Prishtina | 29,7% (11) 54,1% (20) 8,1% (3) 5,4% (2) | 37 | 24,1 |
| 15 | Spartak Moskau | 32,6% (15) 56,5% (26) 6,5% (3) 4,3% (2) | 46 | 24,4 |
| 16 | Y.B. Bern | 31,7% (13) 53,7% (22) 7,3% (3) 7,3% (3) | 41 | 24,4 |
| 17 | FK Buducnost | 34,5% (10) 34,5% (10) 13,8% (4) 6,9% (2) | 29 | 24,4 |
| 18 | Sparta Prag | 22,9% (11) 54,2% (26) 18,8% (9) 2,1% (1) | 48 | 24,6 |
| 19 | Banja Luka | 34,5% (10) 44,8% (13) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,7 |
| 20 | Slavia Prag | 31,6% (18) 43,9% (25) 19,3% (11) 5,3% (3) | 57 | 24,7 |
| 21 | Monaco | 32,6% (15) 43,5% (20) 15,2% (7) 8,7% (4) | 46 | 24,7 |
| 22 | HJK Helsinki | 33,3% (14) 38,1% (16) 19,0% (8) 9,5% (4) | 42 | 24,8 |
| 23 | HB Torshavn | 23,5% (8) 55,9% (19) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 24,9 |
| 24 | S. Tiraspol | 19,5% (8) 68,3% (28) 7,3% (3) 4,9% (2) | 41 | 25,0 |
| 25 | M. Haifa | 24,6% (14) 54,4% (31) 15,8% (9) 5,3% (3) | 57 | 25,0 |
| 26 | R. S. Belgrad | 35,3% (18) 31,4% (16) 27,5% (14) 3,9% (2) | 51 | 25,1 |
| 27 | Malmö FF | 26,7% (12) 44,4% (20) 13,3% (6) 13,3% (6) | 45 | 25,2 |
| 28 | D. Tiflis | 21,6% (8) 43,2% (16) 18,9% (7) 2,7% (1) | 37 | 25,3 |
| 29 | L. Warschau | 34,0% (16) 36,2% (17) 23,4% (11) 6,4% (3) | 47 | 25,4 |
| 30 | N. Baku | 27,6% (8) 41,4% (12) 24,1% (7) 6,9% (2) | 29 | 25,6 |
| 31 | Fola Esch | 25,6% (10) 41,0% (16) 20,5% (8) 12,8% (5) | 39 | 25,8 |
| 32 | Tetovo | 21,2% (7) 57,6% (19) 12,1% (4) 9,1% (3) | 33 | 25,8 |
| 33 | Olympiakos | 20,3% (14) 47,8% (33) 24,6% (17) 7,2% (5) | 69 | 26,1 |
| 34 | SK SLovan | 11,9% (5) 57,1% (24) 23,8% (10) 7,1% (3) | 42 | 26,2 |
| 35 | Shamrock | 27,6% (8) 37,9% (11) 20,7% (6) 13,8% (4) | 29 | 26,2 |
| 36 | Ferencvárosi | 17,5% (7) 55,0% (22) 25,0% (10) 2,5% (1) | 40 | 26,3 |
| 37 | Saligorsk | 15,6% (5) 53,1% (17) 21,9% (7) 9,4% (3) | 32 | 26,3 |
| 38 | Galatasaray | 23,2% (16) 47,8% (33) 17,4% (12) 11,6% (8) | 69 | 26,3 |
| 39 | Ludogorets | 17,1% (7) 46,3% (19) 26,8% (11) 4,9% (2) | 41 | 26,3 |
| 40 | Durres | 38,5% (10) 30,8% (8) 7,7% (2) 19,2% (5) | 26 | 26,4 |
| 41 | Gl. Rangers | 25,0% (11) 40,9% (18) 18,2% (8) 13,6% (6) | 44 | 26,4 |
| 42 | FK Rigas Futbo | 6,7% (3) 62,2% (28) 26,7% (12) 2,2% (1) | 45 | 26,5 |
| 43 | Benfica | 20,4% (11) 50,0% (27) 22,2% (12) 7,4% (4) | 54 | 26,6 |
| 44 | Zalgiris | 18,5% (5) 48,1% (13) 22,2% (6) 11,1% (3) | 27 | 26,7 |
| 45 | Om. Nikosia | 26,2% (11) 28,6% (12) 26,2% (11) 19,0% (8) | 42 | 26,9 |
| 46 | Valur | 16,7% (5) 33,3% (10) 40,0% (12) 6,7% (2) | 30 | 27,1 |
| 47 | Linfield | 16,7% (6) 41,7% (15) 22,2% (8) 13,9% (5) | 36 | 27,2 |
| 48 | Cluj | 14,8% (8) 48,1% (26) 24,1% (13) 13,0% (7) | 54 | 27,6 |
| 49 | Paola | 17,4% (8) 34,8% (16) 28,3% (13) 19,6% (9) | 46 | 27,9 |
| 50 | Connah's Quay | 3,7% (1) 37,0% (10) 29,6% (8) 14,8% (4) | 27 | 28,0 |
| 51 | Martuni | 5,3% (2) 36,8% (14) 44,7% (17) 13,2% (5) | 38 | 28,8 |
| 52 | Lincoln FC | 9,5% (4) 40,5% (17) 26,2% (11) 23,8% (10) | 42 | 29,2 |
| 53 | Folgore | 2,2% (1) 26,7% (12) 48,9% (22) 22,2% (10) | 45 | 30,4 |
| 54 | Inter Club de | 1,5% (1) 26,2% (17) 18,5% (12) 44,6% (29) | 65 | 32,3 |
Champions League-Qualifikation
