| 1 | Salzburg | 57,5% (23) 32,5% (13) 2,5% (1) 7,5% (3) | 40 | 22,6 |
| 2 | Alkmaar | 35,9% (14) 53,8% (21) 10,3% (4) | 39 | 23,2 |
| 3 | L. Zagreb | 40,0% (26) 46,2% (30) 10,8% (7) 3,1% (2) | 65 | 23,2 |
| 4 | Dynamo Kiev | 37,1% (23) 51,6% (32) 11,3% (7) | 62 | 23,3 |
| 5 | FC Flora | 38,7% (12) 45,2% (14) 9,7% (3) 6,5% (2) | 31 | 23,4 |
| 6 | NK Celje | 30,0% (6) 55,0% (11) 10,0% (2) | 20 | 23,4 |
| 7 | Rapid Wien | 44,4% (16) 38,9% (14) 11,1% (4) 2,8% (1) | 36 | 23,5 |
| 8 | Celje | 17,4% (4) 78,3% (18) 4,3% (1) | 23 | 23,6 |
| 9 | C. Glasgow | 28,9% (13) 60,0% (27) 11,1% (5) | 45 | 23,8 |
| 10 | Midtjylland | 30,9% (17) 54,5% (30) 10,9% (6) 3,6% (2) | 55 | 24,1 |
| 11 | D. Zagreb | 31,7% (19) 48,3% (29) 16,7% (10) 3,3% (2) | 60 | 24,1 |
| 12 | PAOK Saloniki | 38,0% (19) 40,0% (20) 18,0% (9) 4,0% (2) | 50 | 24,1 |
| 13 | Kuopio PS | 27,9% (12) 53,5% (23) 9,3% (4) 4,7% (2) | 43 | 24,3 |
| 14 | Slavia Prag | 28,6% (14) 59,2% (29) 8,2% (4) 4,1% (2) | 49 | 24,4 |
| 15 | Y.B. Bern | 32,4% (11) 55,9% (19) 5,9% (2) 5,9% (2) | 34 | 24,4 |
| 16 | R. S. Belgrad | 38,1% (16) 35,7% (15) 26,2% (11) | 42 | 24,6 |
| 17 | Besiktas | 37,5% (21) 35,7% (20) 23,2% (13) 3,6% (2) | 56 | 24,8 |
| 18 | FK Buducnost | 25,9% (7) 40,7% (11) 22,2% (6) | 27 | 24,9 |
| 19 | M. Tel Aviv | 28,6% (12) 47,6% (20) 21,4% (9) 2,4% (1) | 42 | 25,0 |
| 20 | Djurgardens | 23,7% (9) 47,4% (18) 26,3% (10) 2,6% (1) | 38 | 25,1 |
| 21 | Ferencvárosi | 22,5% (9) 60,0% (24) 17,5% (7) | 40 | 25,2 |
| 22 | S. Tiraspol | 15,2% (5) 69,7% (23) 9,1% (3) 6,1% (2) | 33 | 25,4 |
| 23 | Floriana | 11,1% (1) 77,8% (7) 11,1% (1) | 9 | 25,4 |
| 24 | Molde | 20,6% (7) 52,9% (18) 26,5% (9) | 34 | 25,5 |
| 25 | Benfica | 17,7% (11) 64,5% (40) 12,9% (8) 4,8% (3) | 62 | 25,5 |
| 26 | D. Tiflis | 25,6% (11) 41,9% (18) 16,3% (7) 2,3% (1) | 43 | 25,5 |
| 27 | Karabakh | 21,2% (7) 45,5% (15) 30,3% (10) 3,0% (1) | 33 | 25,8 |
| 28 | Dundalk | 13,2% (5) 55,3% (21) 18,4% (7) 5,3% (2) | 38 | 25,9 |
| 29 | L. Warschau | 29,8% (14) 34,0% (16) 23,4% (11) 12,8% (6) | 47 | 25,9 |
| 30 | Astana | 23,5% (8) 41,2% (14) 17,6% (6) 5,9% (2) | 34 | 25,9 |
| 31 | KAA Gent | 20,5% (9) 56,8% (25) 20,5% (9) 2,3% (1) | 44 | 25,9 |
| 32 | FC Ararat-Arme | 19,6% (10) 54,9% (28) 19,6% (10) 5,9% (3) | 51 | 26,0 |
| 33 | Olympiakos | 16,7% (8) 56,2% (27) 16,7% (8) 10,4% (5) | 48 | 26,1 |
| 34 | Fola Esch | 23,5% (8) 41,2% (14) 23,5% (8) 11,8% (4) | 34 | 26,1 |
| 35 | Linfield | 21,4% (6) 46,4% (13) 17,9% (5) 10,7% (3) | 28 | 26,3 |
| 36 | Pilsen | 14,3% (5) 57,1% (20) 22,9% (8) 5,7% (2) | 35 | 26,3 |
| 37 | Riga FC | 18,9% (10) 49,1% (26) 20,8% (11) 11,3% (6) | 53 | 26,3 |
| 38 | Krasnodar | 22,5% (9) 42,5% (17) 27,5% (11) 7,5% (3) | 40 | 26,3 |
| 39 | Floriana FC | 100,0% (6) | 6 | 26,5 |
| 40 | Om. Nikosia | 25,0% (9) 36,1% (13) 27,8% (10) 11,1% (4) | 36 | 26,5 |
| 41 | Ludogorets | 8,1% (3) 62,2% (23) 21,6% (8) 5,4% (2) | 37 | 26,6 |
| 42 | Marijampole | 26,5% (9) 38,2% (13) 26,5% (9) 8,8% (3) | 34 | 26,6 |
| 43 | KF Drita | 4,5% (1) 59,1% (13) 36,4% (8) | 22 | 26,6 |
| 44 | FC Europa | 15,0% (3) 40,0% (8) 35,0% (7) 10,0% (2) | 20 | 27,0 |
| 45 | Klaksvik | 12,0% (3) 52,0% (13) 24,0% (6) 8,0% (2) | 25 | 27,1 |
| 46 | FK Sarajevo | 11,1% (2) 50,0% (9) 33,3% (6) 5,6% (1) | 18 | 27,1 |
| 47 | Kratovo | 9,1% (1) 36,4% (4) 45,5% (5) | 11 | 27,2 |
| 48 | Brest | 15,4% (4) 34,6% (9) 30,8% (8) 15,4% (4) | 26 | 27,4 |
| 49 | FK Tirana | 8,3% (2) 70,8% (17) 4,2% (1) 16,7% (4) | 24 | 27,5 |
| 50 | Cluj | 16,1% (9) 41,1% (23) 28,6% (16) 14,3% (8) | 56 | 27,6 |
| 51 | Connah's Quay | 11,5% (3) 34,6% (9) 34,6% (9) 19,2% (5) | 26 | 28,6 |
| 52 | KR Reykjavik | 14,3% (2) 28,6% (4) 28,6% (4) 28,6% (4) | 14 | 28,7 |
| 53 | Tre Fiori | 50,0% (7) 14,3% (2) 35,7% (5) | 14 | 29,9 |
| 54 | Inter Club de | 3,6% (2) 29,1% (16) 14,5% (8) 43,6% (24) | 55 | 31,6 |
Champions League-Qualifikation
