| 1 | Ajax Amsterdam | 68,8% (44) 20,3% (13) 6,2% (4) 4,7% (3) | 64 | 22,1 |
| 2 | Midtjylland | 51,6% (33) 37,5% (24) 7,8% (5) 3,1% (2) | 64 | 22,1 |
| 3 | Eindhoven | 50,0% (31) 37,1% (23) 6,5% (4) 4,8% (3) | 62 | 22,6 |
| 4 | Salzburg | 57,9% (22) 31,6% (12) 5,3% (2) 5,3% (2) | 38 | 22,6 |
| 5 | Y.B. Bern | 29,6% (8) 63,0% (17) 3,7% (1) 3,7% (1) | 27 | 22,8 |
| 6 | FC Basel | 45,2% (19) 35,7% (15) 16,7% (7) 2,4% (1) | 42 | 23,0 |
| 7 | Cork | 32,4% (11) 52,9% (18) 2,9% (1) 5,9% (2) | 34 | 23,2 |
| 8 | FC Flora | 32,5% (13) 52,5% (21) 7,5% (3) 7,5% (3) | 40 | 23,2 |
| 9 | Spartak Moskau | 44,2% (19) 46,5% (20) 4,7% (2) 4,7% (2) | 43 | 23,2 |
| 10 | Dynamo Kiev | 38,8% (19) 46,9% (23) 10,2% (5) | 49 | 23,2 |
| 11 | Benfica | 42,9% (30) 44,3% (31) 10,0% (7) 2,9% (2) | 70 | 23,2 |
| 12 | HJK Helsinki | 46,2% (18) 35,9% (14) 15,4% (6) 2,6% (1) | 39 | 23,6 |
| 13 | D. Zagreb | 38,1% (16) 47,6% (20) 14,3% (6) | 42 | 23,6 |
| 14 | C. Glasgow | 42,6% (20) 42,6% (20) 8,5% (4) 6,4% (3) | 47 | 23,7 |
| 15 | O. Ljubljana | 34,2% (13) 60,5% (23) 5,3% (2) | 38 | 23,8 |
| 16 | Rosenborg BK | 38,5% (15) 41,0% (16) 17,9% (7) 2,6% (1) | 39 | 24,1 |
| 17 | Trnava | 27,6% (8) 51,7% (15) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,2 |
| 18 | Malmö FF | 50,0% (21) 23,8% (10) 16,7% (7) 7,1% (3) | 42 | 24,2 |
| 19 | H. Valletta | 43,8% (14) 25,0% (8) 28,1% (9) 3,1% (1) | 32 | 24,3 |
| 20 | Slavia Prag | 30,0% (12) 55,0% (22) 15,0% (6) | 40 | 24,3 |
| 21 | Jurmala | 44,4% (16) 25,0% (9) 25,0% (9) 5,6% (2) | 36 | 24,4 |
| 22 | AEK Athen | 31,1% (14) 53,3% (24) 15,6% (7) | 45 | 24,4 |
| 23 | R. S. Belgrad | 26,1% (12) 56,5% (26) 17,4% (8) | 46 | 24,5 |
| 24 | Sturm Graz | 28,2% (11) 53,8% (21) 17,9% (7) | 39 | 24,6 |
| 25 | Sutjeska | 27,6% (8) 51,7% (15) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,6 |
| 26 | PAOK Saloniki | 33,3% (16) 37,5% (18) 27,1% (13) 2,1% (1) | 48 | 24,7 |
| 27 | Lüttich | 19,0% (8) 61,9% (26) 16,7% (7) 2,4% (1) | 42 | 24,9 |
| 28 | Apoel FC | 31,6% (12) 34,2% (13) 26,3% (10) 7,9% (3) | 38 | 25,0 |
| 29 | FK Sutjeska Fo | 30,8% (4) 38,5% (5) 23,1% (3) 7,7% (1) | 13 | 25,0 |
| 30 | Kutaisi | 31,8% (7) 45,5% (10) 9,1% (2) 9,1% (2) | 22 | 25,0 |
| 31 | Tetovo | 20,0% (7) 57,1% (20) 22,9% (8) | 35 | 25,1 |
| 32 | BATE | 19,4% (6) 48,4% (15) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,3 |
| 33 | Fehervar | 17,4% (4) 60,9% (14) 17,4% (4) 4,3% (1) | 23 | 25,4 |
| 34 | Llansantffraid | 29,2% (7) 33,3% (8) 29,2% (7) 4,2% (1) | 24 | 25,5 |
| 35 | L. Warschau | 27,9% (12) 44,2% (19) 18,6% (8) 9,3% (4) | 43 | 25,5 |
| 36 | Fenerbahce | 22,4% (11) 46,9% (23) 22,4% (11) 8,2% (4) | 49 | 25,6 |
| 37 | Mostar | 17,2% (5) 51,7% (15) 27,6% (8) 3,4% (1) | 29 | 25,8 |
| 38 | S. Tiraspol | 13,3% (4) 60,0% (18) 20,0% (6) 6,7% (2) | 30 | 25,9 |
| 39 | Valur | 19,4% (6) 54,8% (17) 12,9% (4) 12,9% (4) | 31 | 25,9 |
| 40 | Astana | 21,1% (8) 28,9% (11) 34,2% (13) 5,3% (2) | 38 | 26,1 |
| 41 | Dudelange | 22,9% (8) 40,0% (14) 31,4% (11) 5,7% (2) | 35 | 26,3 |
| 42 | Göta | 26,1% (6) 34,8% (8) 21,7% (5) 17,4% (4) | 23 | 26,3 |
| 43 | Crusaders | 20,0% (7) 40,0% (14) 28,6% (10) 8,6% (3) | 35 | 26,3 |
| 44 | KF Drita | 8,3% (2) 66,7% (16) 20,8% (5) 4,2% (1) | 24 | 26,5 |
| 45 | KS Kukesi | 12,8% (5) 56,4% (22) 23,1% (9) 7,7% (3) | 39 | 26,5 |
| 46 | Karabakh | 15,4% (4) 50,0% (13) 34,6% (9) | 26 | 26,5 |
| 47 | Videoton | 17,9% (5) 46,4% (13) 25,0% (7) 10,7% (3) | 28 | 26,6 |
| 48 | Cluj | 21,4% (9) 45,2% (19) 23,8% (10) 9,5% (4) | 42 | 26,8 |
| 49 | Ludogorets | 17,1% (6) 37,1% (13) 34,3% (12) 8,6% (3) | 35 | 26,8 |
| 50 | Beer Sheva | 11,4% (4) 54,3% (19) 28,6% (10) 5,7% (2) | 35 | 26,9 |
| 51 | Martuni | 2,9% (1) 55,9% (19) 38,2% (13) 2,9% (1) | 34 | 27,1 |
| 52 | Lincoln FC | 12,0% (3) 44,0% (11) 32,0% (8) 12,0% (3) | 25 | 27,2 |
| 53 | Marijampole | 9,7% (3) 45,2% (14) 41,9% (13) 3,2% (1) | 31 | 27,5 |
| 54 | Valletta | 10,0% (1) 50,0% (5) 40,0% (4) | 10 | 27,8 |
| 55 | Sta Coloma | 11,1% (4) 38,9% (14) 25,0% (9) 22,2% (8) | 36 | 28,8 |
| 56 | Santa Coloma | 14,3% (1) 42,9% (3) 14,3% (1) 28,6% (2) | 7 | 29,0 |
| 57 | SP La Fiorit | 11,4% (4) 34,3% (12) 22,9% (8) 31,4% (11) | 35 | 30,2 |
Champions League-Qualifikation
