| 1 | Ajax Amsterdam | 68,3% (41) 20,0% (12) 6,7% (4) 5,0% (3) | 60 | 22,1 |
| 2 | Midtjylland | 45,5% (25) 41,8% (23) 9,1% (5) 3,6% (2) | 55 | 22,4 |
| 3 | Eindhoven | 47,5% (28) 39,0% (23) 6,8% (4) 5,1% (3) | 59 | 22,7 |
| 4 | FC Flora | 37,1% (13) 45,7% (16) 8,6% (3) 8,6% (3) | 35 | 22,9 |
| 5 | Cork | 34,3% (12) 51,4% (18) 5,7% (2) | 35 | 22,9 |
| 6 | Y.B. Bern | 27,6% (8) 65,5% (19) 3,4% (1) 3,4% (1) | 29 | 22,9 |
| 7 | Salzburg | 54,3% (19) 34,3% (12) 5,7% (2) 5,7% (2) | 35 | 22,9 |
| 8 | FC Basel | 42,9% (18) 38,1% (16) 16,7% (7) 2,4% (1) | 42 | 23,1 |
| 9 | Spartak Moskau | 45,2% (19) 45,2% (19) 4,8% (2) 4,8% (2) | 42 | 23,2 |
| 10 | Dynamo Kiev | 37,8% (17) 46,7% (21) 11,1% (5) | 45 | 23,4 |
| 11 | HJK Helsinki | 46,2% (18) 35,9% (14) 15,4% (6) 2,6% (1) | 39 | 23,6 |
| 12 | C. Glasgow | 41,3% (19) 43,5% (20) 8,7% (4) 6,5% (3) | 46 | 23,7 |
| 13 | D. Zagreb | 37,8% (14) 45,9% (17) 16,2% (6) | 37 | 23,9 |
| 14 | Rosenborg BK | 42,1% (16) 36,8% (14) 18,4% (7) 2,6% (1) | 38 | 23,9 |
| 15 | O. Ljubljana | 33,3% (12) 61,1% (22) 5,6% (2) | 36 | 23,9 |
| 16 | Benfica | 35,1% (20) 49,1% (28) 12,3% (7) 3,5% (2) | 57 | 23,9 |
| 17 | Malmö FF | 51,2% (22) 23,3% (10) 16,3% (7) 7,0% (3) | 43 | 24,2 |
| 18 | Slavia Prag | 31,7% (13) 53,7% (22) 14,6% (6) | 41 | 24,2 |
| 19 | Trnava | 27,6% (8) 51,7% (15) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,2 |
| 20 | H. Valletta | 43,8% (14) 25,0% (8) 28,1% (9) 3,1% (1) | 32 | 24,3 |
| 21 | AEK Athen | 32,6% (14) 51,2% (22) 16,3% (7) | 43 | 24,3 |
| 22 | R. S. Belgrad | 27,1% (13) 54,2% (26) 16,7% (8) | 48 | 24,4 |
| 23 | Jurmala | 44,4% (16) 25,0% (9) 25,0% (9) 5,6% (2) | 36 | 24,4 |
| 24 | Sturm Graz | 27,5% (11) 55,0% (22) 17,5% (7) | 40 | 24,5 |
| 25 | Apoel FC | 30,8% (12) 35,9% (14) 25,6% (10) 7,7% (3) | 39 | 24,9 |
| 26 | Kutaisi | 30,4% (7) 47,8% (11) 8,7% (2) 8,7% (2) | 23 | 25,0 |
| 27 | Sutjeska | 25,8% (8) 51,6% (16) 19,4% (6) 3,2% (1) | 31 | 25,0 |
| 28 | Lüttich | 18,4% (7) 63,2% (24) 15,8% (6) 2,6% (1) | 38 | 25,0 |
| 29 | PAOK Saloniki | 30,4% (14) 37,0% (17) 30,4% (14) 2,2% (1) | 46 | 25,1 |
| 30 | Tetovo | 20,0% (7) 54,3% (19) 25,7% (9) | 35 | 25,1 |
| 31 | Llansantffraid | 32,0% (8) 32,0% (8) 28,0% (7) 4,0% (1) | 25 | 25,2 |
| 32 | FK Sutjeska Fo | 28,6% (4) 42,9% (6) 21,4% (3) 7,1% (1) | 14 | 25,2 |
| 33 | L. Warschau | 28,6% (12) 45,2% (19) 16,7% (7) 9,5% (4) | 42 | 25,2 |
| 34 | BATE | 19,4% (6) 48,4% (15) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,3 |
| 35 | Fehervar | 17,4% (4) 60,9% (14) 17,4% (4) 4,3% (1) | 23 | 25,3 |
| 36 | Fenerbahce | 23,4% (11) 42,6% (20) 25,5% (12) 8,5% (4) | 47 | 25,8 |
| 37 | Mostar | 17,2% (5) 51,7% (15) 27,6% (8) 3,4% (1) | 29 | 25,8 |
| 38 | Valur | 18,8% (6) 56,2% (18) 12,5% (4) 12,5% (4) | 32 | 25,8 |
| 39 | S. Tiraspol | 15,6% (5) 56,2% (18) 21,9% (7) 6,2% (2) | 32 | 25,9 |
| 40 | Astana | 22,5% (9) 27,5% (11) 35,0% (14) 5,0% (2) | 40 | 25,9 |
| 41 | Göta | 26,1% (6) 34,8% (8) 21,7% (5) 17,4% (4) | 23 | 26,3 |
| 42 | Dudelange | 24,2% (8) 36,4% (12) 33,3% (11) 6,1% (2) | 33 | 26,3 |
| 43 | Crusaders | 20,6% (7) 38,2% (13) 29,4% (10) 8,8% (3) | 34 | 26,4 |
| 44 | KF Drita | 8,3% (2) 66,7% (16) 20,8% (5) 4,2% (1) | 24 | 26,5 |
| 45 | Karabakh | 15,4% (4) 50,0% (13) 34,6% (9) | 26 | 26,5 |
| 46 | Cluj | 23,8% (10) 42,9% (18) 23,8% (10) 9,5% (4) | 42 | 26,7 |
| 47 | Videoton | 18,5% (5) 44,4% (12) 25,9% (7) 11,1% (3) | 27 | 26,7 |
| 48 | KS Kukesi | 10,5% (4) 55,3% (21) 26,3% (10) 7,9% (3) | 38 | 26,7 |
| 49 | Beer Sheva | 11,1% (4) 55,6% (20) 27,8% (10) 5,6% (2) | 36 | 26,9 |
| 50 | Martuni | 5,7% (2) 54,3% (19) 37,1% (13) 2,9% (1) | 35 | 27,0 |
| 51 | Ludogorets | 14,7% (5) 38,2% (13) 35,3% (12) 8,8% (3) | 34 | 27,0 |
| 52 | Lincoln FC | 11,5% (3) 46,2% (12) 30,8% (8) 11,5% (3) | 26 | 27,1 |
| 53 | Valletta | 9,1% (1) 54,5% (6) 36,4% (4) | 11 | 27,5 |
| 54 | Marijampole | 9,7% (3) 45,2% (14) 41,9% (13) 3,2% (1) | 31 | 27,5 |
| 55 | Sta Coloma | 11,1% (4) 38,9% (14) 25,0% (9) 22,2% (8) | 36 | 28,8 |
| 56 | Santa Coloma | 14,3% (1) 42,9% (3) 14,3% (1) 28,6% (2) | 7 | 29,4 |
| 57 | SP La Fiorit | 11,4% (4) 34,3% (12) 22,9% (8) 31,4% (11) | 35 | 30,2 |
Champions League-Qualifikation
