| 1 | Midtjylland | 54,1% (33) 34,4% (21) 8,2% (5) 3,3% (2) | 61 | 22,1 |
| 2 | Ajax Amsterdam | 67,7% (44) 21,5% (14) 6,2% (4) 4,6% (3) | 65 | 22,1 |
| 3 | Eindhoven | 50,0% (30) 36,7% (22) 6,7% (4) 5,0% (3) | 60 | 22,6 |
| 4 | Y.B. Bern | 29,6% (8) 63,0% (17) 3,7% (1) 3,7% (1) | 27 | 22,8 |
| 5 | Salzburg | 54,3% (19) 34,3% (12) 5,7% (2) 5,7% (2) | 35 | 22,9 |
| 6 | FC Basel | 46,3% (19) 34,1% (14) 17,1% (7) 2,4% (1) | 41 | 23,0 |
| 7 | Cork | 32,4% (11) 52,9% (18) 2,9% (1) 5,9% (2) | 34 | 23,2 |
| 8 | FC Flora | 32,5% (13) 52,5% (21) 7,5% (3) 7,5% (3) | 40 | 23,2 |
| 9 | Spartak Moskau | 44,2% (19) 46,5% (20) 4,7% (2) 4,7% (2) | 43 | 23,2 |
| 10 | Benfica | 42,6% (29) 44,1% (30) 10,3% (7) 2,9% (2) | 68 | 23,3 |
| 11 | Dynamo Kiev | 37,5% (18) 47,9% (23) 10,4% (5) | 48 | 23,3 |
| 12 | D. Zagreb | 37,8% (14) 48,6% (18) 13,5% (5) | 37 | 23,7 |
| 13 | C. Glasgow | 41,3% (19) 43,5% (20) 8,7% (4) 6,5% (3) | 46 | 23,7 |
| 14 | O. Ljubljana | 34,2% (13) 60,5% (23) 5,3% (2) | 38 | 23,8 |
| 15 | HJK Helsinki | 42,9% (15) 37,1% (13) 17,1% (6) 2,9% (1) | 35 | 23,8 |
| 16 | Trnava | 28,6% (8) 50,0% (14) 17,9% (5) 3,6% (1) | 28 | 24,2 |
| 17 | H. Valletta | 43,8% (14) 25,0% (8) 28,1% (9) 3,1% (1) | 32 | 24,3 |
| 18 | Malmö FF | 48,8% (20) 24,4% (10) 17,1% (7) 7,3% (3) | 41 | 24,4 |
| 19 | Rosenborg BK | 35,1% (13) 43,2% (16) 18,9% (7) 2,7% (1) | 37 | 24,4 |
| 20 | Jurmala | 44,1% (15) 23,5% (8) 26,5% (9) 5,9% (2) | 34 | 24,5 |
| 21 | Sturm Graz | 30,6% (11) 50,0% (18) 19,4% (7) | 36 | 24,5 |
| 22 | R. S. Belgrad | 25,0% (11) 59,1% (26) 15,9% (7) | 44 | 24,5 |
| 23 | Sutjeska | 27,6% (8) 51,7% (15) 17,2% (5) 3,4% (1) | 29 | 24,6 |
| 24 | AEK Athen | 27,9% (12) 55,8% (24) 16,3% (7) | 43 | 24,7 |
| 25 | Slavia Prag | 28,2% (11) 56,4% (22) 15,4% (6) | 39 | 24,7 |
| 26 | PAOK Saloniki | 34,8% (16) 34,8% (16) 28,3% (13) 2,2% (1) | 46 | 24,8 |
| 27 | Lüttich | 19,5% (8) 61,0% (25) 17,1% (7) 2,4% (1) | 41 | 24,9 |
| 28 | Apoel FC | 31,6% (12) 34,2% (13) 26,3% (10) 7,9% (3) | 38 | 25,0 |
| 29 | FK Sutjeska Fo | 30,8% (4) 38,5% (5) 23,1% (3) 7,7% (1) | 13 | 25,0 |
| 30 | Kutaisi | 31,8% (7) 45,5% (10) 9,1% (2) 9,1% (2) | 22 | 25,0 |
| 31 | Tetovo | 20,6% (7) 55,9% (19) 23,5% (8) | 34 | 25,1 |
| 32 | BATE | 21,4% (6) 46,4% (13) 28,6% (8) 3,6% (1) | 28 | 25,2 |
| 33 | Fehervar | 17,4% (4) 60,9% (14) 17,4% (4) 4,3% (1) | 23 | 25,4 |
| 34 | L. Warschau | 26,2% (11) 45,2% (19) 19,0% (8) 9,5% (4) | 42 | 25,6 |
| 35 | Llansantffraid | 26,1% (6) 34,8% (8) 30,4% (7) 4,3% (1) | 23 | 25,7 |
| 36 | Fenerbahce | 21,3% (10) 46,8% (22) 23,4% (11) 8,5% (4) | 47 | 25,8 |
| 37 | Mostar | 17,2% (5) 51,7% (15) 27,6% (8) 3,4% (1) | 29 | 25,8 |
| 38 | S. Tiraspol | 13,3% (4) 60,0% (18) 20,0% (6) 6,7% (2) | 30 | 25,9 |
| 39 | Valur | 19,4% (6) 54,8% (17) 12,9% (4) 12,9% (4) | 31 | 25,9 |
| 40 | Astana | 20,0% (7) 28,6% (10) 34,3% (12) 5,7% (2) | 35 | 26,2 |
| 41 | Göta | 26,1% (6) 34,8% (8) 21,7% (5) 17,4% (4) | 23 | 26,3 |
| 42 | Crusaders | 20,6% (7) 38,2% (13) 29,4% (10) 8,8% (3) | 34 | 26,3 |
| 43 | KS Kukesi | 12,8% (5) 56,4% (22) 23,1% (9) 7,7% (3) | 39 | 26,5 |
| 44 | Dudelange | 21,2% (7) 39,4% (13) 33,3% (11) 6,1% (2) | 33 | 26,5 |
| 45 | Karabakh | 15,4% (4) 50,0% (13) 34,6% (9) | 26 | 26,5 |
| 46 | KF Drita | 8,7% (2) 65,2% (15) 21,7% (5) 4,3% (1) | 23 | 26,6 |
| 47 | Videoton | 17,9% (5) 46,4% (13) 25,0% (7) 10,7% (3) | 28 | 26,6 |
| 48 | Beer Sheva | 11,8% (4) 55,9% (19) 26,5% (9) 5,9% (2) | 34 | 26,7 |
| 49 | Cluj | 21,4% (9) 45,2% (19) 23,8% (10) 9,5% (4) | 42 | 26,8 |
| 50 | Martuni | 3,2% (1) 61,3% (19) 32,3% (10) 3,2% (1) | 31 | 26,9 |
| 51 | Ludogorets | 17,6% (6) 35,3% (12) 35,3% (12) 8,8% (3) | 34 | 26,9 |
| 52 | Lincoln FC | 11,5% (3) 46,2% (12) 30,8% (8) 11,5% (3) | 26 | 27,1 |
| 53 | Marijampole | 9,7% (3) 45,2% (14) 41,9% (13) 3,2% (1) | 31 | 27,5 |
| 54 | Valletta | 11,1% (1) 55,6% (5) 33,3% (3) | 9 | 27,6 |
| 55 | Sta Coloma | 11,1% (4) 38,9% (14) 25,0% (9) 22,2% (8) | 36 | 28,8 |
| 56 | SP La Fiorit | 11,4% (4) 34,3% (12) 22,9% (8) 31,4% (11) | 35 | 30,2 |
Champions League-Qualifikation
